Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP4Q9H3Q1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP4Q9H3Q1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms