Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIOBPQ9H2D6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOBPQ9H2D6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms