Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB17Q9H0T7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB17Q9H0T7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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