Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms