Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CCSER1Q9C0I3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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