Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRCC1Q9C099 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRCC1Q9C099 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms