Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM5Q9C035 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms