Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF2Q9BZW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF2Q9BZW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms