Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SCAPERQ9BY12 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCAPERQ9BY12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms