Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARD11Q9BXL7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms