Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGPP1Q9BX95 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGPP1Q9BX95 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms