Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LSM14BQ9BX40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms