Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYCP2Q9BX26 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYCP2Q9BX26 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms