Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM2Q9BVW6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms