Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKNK1Q9BUB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKNK1Q9BUB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms