Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFAF3Q9BU61 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms