Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFJQ9BTM1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFJQ9BTM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms