Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS4Q9BT78 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms