Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDFIP1Q9BT67 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms