Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP6Q9BRS8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP6Q9BRS8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms