Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPPED1Q9BRF8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms