Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF4Q9BQW3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms