Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCF25Q9BQ70 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms