Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM7Q9BQ49 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms