Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL2Q99962 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms