Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms