Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX2Q99697 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms