Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.6 ms