Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms