Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIN3AQ96ST3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms