Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT8L2Q96SF2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms