Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP5Q96RT8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms