Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED4Q96RK1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms