Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3IPQ96QF0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms