Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU8

QKI, Protein quaking, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKIQ96PU8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 46.9
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QKIQ96PU8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 46.9
QKIQ96PU8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 46.9
QKIQ96PU8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 46.9
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QKIQ96PU8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.515e-14■■■■■ 46.8
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QKIQ96PU8 LINC01194-202ENST00000505877 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.198e-8■■■■■ 46.7
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QKIQ96PU8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 46.3
QKIQ96PU8 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 46.3
QKIQ96PU8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.663e-8■■■■■ 46.3
QKIQ96PU8 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.163e-8■■■■■ 46.3
QKIQ96PU8 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 46.3
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