Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms