Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH12Q96NR8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms