Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF396Q96N95 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms