Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT74Q96LB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms