Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZA3Q96KX2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms