Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPGRIP1Q96KN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms