Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms