Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC136Q96JN2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms