Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMX3Q96JJ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms