Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC11Q96J66 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ABCC11Q96J66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC11Q96J66 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms