Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSL1Q96IY1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSL1Q96IY1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms