Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22AQ96IW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms