Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms