Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED8Q96G25 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED8Q96G25 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms