Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms